Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Wdr54Q9R0D8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Wdr54Q9R0D8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.6 ms