Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lamc3Q9R0B6 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamc3Q9R0B6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms