Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rnf4Q9QZS2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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