Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 925 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Npas3Q9QZQ0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Npas3Q9QZQ0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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