Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ercc4Q9QZD4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms