Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ubxn8Q9QZ49 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn8Q9QZ49 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms