Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ndrg3Q9QYF9 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms