Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Irx4Q9QY61 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Irx4Q9QY61 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms