Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nr2e3Q9QXZ7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms