Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trim44Q9QXA7 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim44Q9QXA7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim44Q9QXA7 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim44Q9QXA7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim44Q9QXA7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trim44Q9QXA7 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim44Q9QXA7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim44Q9QXA7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim44Q9QXA7 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim44Q9QXA7 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim44Q9QXA7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim44Q9QXA7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim44Q9QXA7 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim44Q9QXA7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim44Q9QXA7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim44Q9QXA7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim44Q9QXA7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim44Q9QXA7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim44Q9QXA7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim44Q9QXA7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim44Q9QXA7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim44Q9QXA7 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trim44Q9QXA7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms