Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Dkk3Q9QUN9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Dkk3Q9QUN9 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Dkk3Q9QUN9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Dkk3Q9QUN9 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Dkk3Q9QUN9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Dkk3Q9QUN9 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Dkk3Q9QUN9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Dkk3Q9QUN9 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Dkk3Q9QUN9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Dkk3Q9QUN9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Dkk3Q9QUN9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Dkk3Q9QUN9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms