Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Csnk1eQ9JMK2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Csnk1eQ9JMK2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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