Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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SrfQ9JM73 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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SrfQ9JM73 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SrfQ9JM73 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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