Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rabgef1Q9JM13 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rabgef1Q9JM13 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rabgef1Q9JM13 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rabgef1Q9JM13 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Rabgef1Q9JM13 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Rabgef1Q9JM13 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Rabgef1Q9JM13 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Rabgef1Q9JM13 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rabgef1Q9JM13 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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