Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gde1Q9JL56 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gde1Q9JL56 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms