Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Msgn1Q9JK54 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms