Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ccdc86Q9JJ89 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ccdc86Q9JJ89 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ccdc86Q9JJ89 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ccdc86Q9JJ89 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ccdc86Q9JJ89 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ccdc86Q9JJ89 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ccdc86Q9JJ89 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ccdc86Q9JJ89 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Ccdc86Q9JJ89 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ccdc86Q9JJ89 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ccdc86Q9JJ89 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc86Q9JJ89 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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