Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpf2Q9JJ80 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpf2Q9JJ80 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms