Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIH2

Nup50, Nuclear pore complex protein Nup50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup50Q9JIH2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup50Q9JIH2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup50Q9JIH2 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms