Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS4

Clpx, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpxQ9JHS4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ClpxQ9JHS4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms