Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Cldn12Q9ET43 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Cldn12Q9ET43 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cldn12Q9ET43 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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