Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tfcp2Q9ERA0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms