Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tlr1Q9EPQ1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Tlr1Q9EPQ1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tlr1Q9EPQ1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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