Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Clstn1Q9EPL2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn1Q9EPL2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms