Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eif3fQ9DCH4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms