Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC60

Ubiad1, UbiA prenyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubiad1Q9DC60 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ubiad1Q9DC60 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubiad1Q9DC60 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubiad1Q9DC60 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubiad1Q9DC60 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubiad1Q9DC60 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubiad1Q9DC60 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubiad1Q9DC60 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubiad1Q9DC60 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubiad1Q9DC60 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubiad1Q9DC60 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubiad1Q9DC60 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubiad1Q9DC60 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubiad1Q9DC60 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubiad1Q9DC60 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubiad1Q9DC60 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubiad1Q9DC60 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubiad1Q9DC60 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubiad1Q9DC60 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubiad1Q9DC60 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubiad1Q9DC60 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubiad1Q9DC60 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ubiad1Q9DC60 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubiad1Q9DC60 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubiad1Q9DC60 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubiad1Q9DC60 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubiad1Q9DC60 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ubiad1Q9DC60 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms