Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cmtr1Q9DBC3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms