Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph3bQ9DA80 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms