Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc89Q9DA73 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms