Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem239Q9DA47 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Tmem239Q9DA47 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tmem239Q9DA47 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tmem239Q9DA47 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tmem239Q9DA47 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tmem239Q9DA47 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem239Q9DA47 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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