Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgf29Q9DA08 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms