Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D9

Uncharacterized protein C1orf189 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9D9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D9D9 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D9D9 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D9D9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D9D9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D9D9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9D9D9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D9D9 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D9D9 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D9D9 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D9D9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms