Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rexo2Q9D8S4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rexo2Q9D8S4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms