Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Slc52a2Q9D8F3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc52a2Q9D8F3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc52a2Q9D8F3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc52a2Q9D8F3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc52a2Q9D8F3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc52a2Q9D8F3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc52a2Q9D8F3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc52a2Q9D8F3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc52a2Q9D8F3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc52a2Q9D8F3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc52a2Q9D8F3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc52a2Q9D8F3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms