Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp4bQ9D8B3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms