Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Cldn22Q9D7U6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn22Q9D7U6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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