Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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Ttc9bQ9D6E4 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Ttc9bQ9D6E4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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Ttc9bQ9D6E4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Ttc9bQ9D6E4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Ttc9bQ9D6E4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Ttc9bQ9D6E4 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Ttc9bQ9D6E4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ttc9bQ9D6E4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ttc9bQ9D6E4 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ttc9bQ9D6E4 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ttc9bQ9D6E4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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