Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9D5Q8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9D5Q8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms