Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efhd1Q9D4J1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms