Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lonrf3Q9D4H7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms