Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clvs1Q9D4C9 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clvs1Q9D4C9 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clvs1Q9D4C9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clvs1Q9D4C9 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clvs1Q9D4C9 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clvs1Q9D4C9 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clvs1Q9D4C9 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clvs1Q9D4C9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clvs1Q9D4C9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clvs1Q9D4C9 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clvs1Q9D4C9 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clvs1Q9D4C9 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clvs1Q9D4C9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clvs1Q9D4C9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clvs1Q9D4C9 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clvs1Q9D4C9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clvs1Q9D4C9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Clvs1Q9D4C9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clvs1Q9D4C9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clvs1Q9D4C9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Clvs1Q9D4C9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clvs1Q9D4C9 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clvs1Q9D4C9 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clvs1Q9D4C9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clvs1Q9D4C9 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clvs1Q9D4C9 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clvs1Q9D4C9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clvs1Q9D4C9 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Clvs1Q9D4C9 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clvs1Q9D4C9 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clvs1Q9D4C9 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clvs1Q9D4C9 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clvs1Q9D4C9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clvs1Q9D4C9 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clvs1Q9D4C9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clvs1Q9D4C9 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clvs1Q9D4C9 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clvs1Q9D4C9 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clvs1Q9D4C9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clvs1Q9D4C9 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clvs1Q9D4C9 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clvs1Q9D4C9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clvs1Q9D4C9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Clvs1Q9D4C9 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Clvs1Q9D4C9 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms