Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cfap53Q9D439 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cfap53Q9D439 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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