Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt20Q9D312 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt20Q9D312 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms