Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Trim42Q9D2H5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Trim42Q9D2H5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim42Q9D2H5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms