Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc6bQ9D289 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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