Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krtap5-3Q9D226 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krtap5-3Q9D226 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krtap5-3Q9D226 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krtap5-3Q9D226 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krtap5-3Q9D226 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krtap5-3Q9D226 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Krtap5-3Q9D226 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krtap5-3Q9D226 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krtap5-3Q9D226 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krtap5-3Q9D226 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krtap5-3Q9D226 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krtap5-3Q9D226 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krtap5-3Q9D226 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krtap5-3Q9D226 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krtap5-3Q9D226 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krtap5-3Q9D226 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krtap5-3Q9D226 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krtap5-3Q9D226 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krtap5-3Q9D226 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krtap5-3Q9D226 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krtap5-3Q9D226 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms