Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
SarnpQ9D1J3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SarnpQ9D1J3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms