Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbed3Q9D0L1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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