Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW6

Rnf146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf146Q9CZW6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rnf146Q9CZW6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rnf146Q9CZW6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf146Q9CZW6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf146Q9CZW6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf146Q9CZW6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf146Q9CZW6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rnf146Q9CZW6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf146Q9CZW6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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