Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Thumpd2Q9CZB3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms